Laboratórne výsledky vznikajú v nemocniciach každý deň. Primárne pomáhajú pri diagnostike konkrétneho pacienta. Keď však tisíce takýchto výsledkov spojíme a analyzujeme v čase, môžu nám povedať oveľa viac – napríklad ako sa mení výskyt baktérií odolných voči antibiotikám. Práve tento prístup sme využili v novej vedeckej publikácii a ďalej ho rozvíjame v aplikácii StaphySearch.

Keď laboratórium vyšetrí vzorku pacienta a identifikuje baktériu, vzniká súbor údajov. Vieme napríklad, aký mikroorganizmus bol zachytený a ako reagoval na testované antibiotiká.

Pre lekára je dôležitý predovšetkým konkrétny výsledok.

Pre epidemiológa alebo výskumníka však môže byť rovnako zaujímavá iná otázka:

Čo sa stane, keď vedľa seba položíme tisíce takýchto výsledkov z niekoľkých rokov?

Práve na túto otázku sme sa pozreli vo vedeckej štúdii zameranej na baktériu Staphylococcus aureus v slovenskom nemocničnom prostredí.

Výsledky boli v apríli 2026 publikované v medzinárodnom vedeckom časopise Antibiotics v článku Monitoring the Burden of Staphylococcus aureus: A Multi-Year Retrospective Study Using Routine Laboratory Data from a Slovak Hospital.

A ukázali, prečo môžu byť dáta z každodennej laboratórnej diagnostiky mimoriadne cenným zdrojom informácií.

Tisíce izolátov, jeden väčší obraz

Výskum analyzoval údaje z rutinných laboratórnych vyšetrení z rokov 2019 až 2025.

Po vyčistení, klasifikácii a odstránení duplicitných údajov tvorilo výsledný dataset 9 186 unikátnych izolátov baktérie Staphylococcus aureus a 127 724 meraní citlivosti na antibiotiká.

To je dôležitý rozdiel oproti pohľadu na jednotlivé laboratórne výsledky.

Jeden výsledok nám môže povedať, aká baktéria sa našla v konkrétnej vzorke a na ktoré antibiotiká je citlivá. Tisíce výsledkov sledovaných počas niekoľkých rokov nám umožňujú položiť otázky na úrovni celej nemocnice:

Ako sa menil výskyt S. aureus?

Menila sa antibiotická rezistencia?

Bol vývoj rovnaký na chirurgických a nechirurgických oddeleniach?

A zanechala pandémia COVID-19 v týchto dátach stopu?

Čo ukázali dáta?

Jedným z najvýznamnejších pozorovaní bolo, že počas pandemického obdobia došlo v analyzovanom nemocničnom datasete k nárastu incidencie multirezistentného Staphylococcus aureus vrátane MRSA.

Tento nárast bol viditeľný najmä v rokoch 2020 až 2022 a pri rezistentných MRSA bol výrazný predovšetkým na chirurgických oddeleniach. V tejto skupine dosiahla incidencia infekcií spôsobených MDR MRSA v niektorých obdobiach až 12,5 prípadu na 1 000 ukončených hospitalizácií.

Dôležité je, že zvýšené hodnoty nezmizli okamžite s koncom akútnej fázy pandémie. Analýza ukázala, že zvýšená incidencia multirezistentných kmeňov pretrvávala aj v postpandemickom období rokov 2023 až 2025.

Výsledky teda naznačujú, že zmeny súvisiace s pandémiou mohli mať na epidemiológiu antibiotickej rezistencie dlhodobejší dosah.

Od vedeckej analýzy k StaphySearch

Cieľom StaphySearch je premieňať rozsiahle mikrobiologické dáta na informácie, ktoré možno jednoduchšie skúmať a vizualizovať.

Namiesto statickej tabuľky tak môže používateľ sledovať napríklad vývoj antibiotickej rezistencie v čase, porovnávať nemocničné oddelenia alebo pomocou vizualizácií hľadať obdobia a miesta so zvýšeným výskytom sledovaných kmeňov.

Publikovaná štúdia pritom poskytuje dôležitý základ.

Ukazuje, že aj dáta, ktoré už vznikajú pri bežnej laboratórnej diagnostike, môžu po správnom spracovaní odhaliť epidemiologické trendy, ktoré pri pohľade na jednotlivé výsledky nevidíme.

StaphySearch má tento princíp ďalej rozvíjať.

Financované EÚ NextGenerationEU prostredníctvom Plánu obnovy a odolnosti SR v rámci projektu č. 09I03-03-V04-00769.